MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 77778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007963	GT	3	6	91	96	0 %	50 %	50 %	0 %	92112137
2	NC_007963	CT	3	6	103	108	0 %	50 %	0 %	50 %	92112137
3	NC_007963	GCA	2	6	110	115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112137
4	NC_007963	TTC	2	6	127	132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112137
5	NC_007963	CAG	2	6	150	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112137
6	NC_007963	TCT	2	6	212	217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112137
7	NC_007963	CGTG	2	8	233	240	0 %	25 %	50 %	25 %	92112137
8	NC_007963	GCT	2	6	278	283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
9	NC_007963	GCC	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112137
10	NC_007963	CGC	2	6	336	341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112137
11	NC_007963	GTC	2	6	353	358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
12	NC_007963	GC	3	6	373	378	0 %	0 %	50 %	50 %	92112137
13	NC_007963	CGA	3	9	388	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112137
14	NC_007963	CCGA	2	8	411	418	25 %	0 %	25 %	50 %	92112137
15	NC_007963	CGG	2	6	424	429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112137
16	NC_007963	CGA	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112137
17	NC_007963	ATCG	2	8	477	484	25 %	25 %	25 %	25 %	92112137
18	NC_007963	CGC	2	6	505	510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112137
19	NC_007963	GGT	2	6	516	521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112137
20	NC_007963	CCAGGT	2	12	530	541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	92112137
21	NC_007963	TCG	2	6	598	603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
22	NC_007963	GGT	2	6	660	665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112137
23	NC_007963	ATGC	2	8	720	727	25 %	25 %	25 %	25 %	92112137
24	NC_007963	GTC	2	6	768	773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
25	NC_007963	TCG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
26	NC_007963	CTG	2	6	870	875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
27	NC_007963	TTC	2	6	891	896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112137
28	NC_007963	GAA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112137
29	NC_007963	TTC	2	6	924	929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112137
30	NC_007963	GCT	2	6	944	949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
31	NC_007963	CAG	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112137
32	NC_007963	GGA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112137
33	NC_007963	GCC	2	6	1061	1066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112137
34	NC_007963	CG	3	6	1078	1083	0 %	0 %	50 %	50 %	92112137
35	NC_007963	TGA	2	6	1093	1098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112137
36	NC_007963	TGC	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
37	NC_007963	CTT	2	6	1142	1147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112137
38	NC_007963	AGA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112137
39	NC_007963	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112137
40	NC_007963	CTG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
41	NC_007963	ACA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112137
42	NC_007963	TAT	2	6	1332	1337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	92112137
43	NC_007963	TCT	2	6	1355	1360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112137
44	NC_007963	CGT	2	6	1368	1373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
45	NC_007963	CG	3	6	1385	1390	0 %	0 %	50 %	50 %	92112137
46	NC_007963	ACCAC	2	10	1474	1483	40 %	0 %	0 %	60 %	92112137
47	NC_007963	TGC	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
48	NC_007963	GAA	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112137
49	NC_007963	CTG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
50	NC_007963	GCT	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112137
51	NC_007963	CGT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
52	NC_007963	CGT	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
53	NC_007963	TGC	2	6	1727	1732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
54	NC_007963	CAC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112138
55	NC_007963	GC	3	6	1843	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	92112138
56	NC_007963	AGGA	2	8	1907	1914	50 %	0 %	50 %	0 %	92112138
57	NC_007963	GCA	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112138
58	NC_007963	CTA	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112138
59	NC_007963	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
60	NC_007963	CCA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112138
61	NC_007963	GC	4	8	2168	2175	0 %	0 %	50 %	50 %	92112138
62	NC_007963	GTCGAG	2	12	2185	2196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	92112138
63	NC_007963	GC	3	6	2242	2247	0 %	0 %	50 %	50 %	92112138
64	NC_007963	CTG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
65	NC_007963	CGA	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112138
66	NC_007963	CGG	2	6	2286	2291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112138
67	NC_007963	GC	3	6	2301	2306	0 %	0 %	50 %	50 %	92112138
68	NC_007963	TCACCT	2	12	2321	2332	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	92112138
69	NC_007963	GTC	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
70	NC_007963	TC	3	6	2448	2453	0 %	50 %	0 %	50 %	92112138
71	NC_007963	GAG	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112138
72	NC_007963	AAC	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112138
73	NC_007963	AAC	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112138
74	NC_007963	AGG	3	9	2528	2536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112138
75	NC_007963	GAG	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112138
76	NC_007963	GC	3	6	2570	2575	0 %	0 %	50 %	50 %	92112138
77	NC_007963	TCG	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
78	NC_007963	CAG	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112138
79	NC_007963	CTG	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112138
80	NC_007963	GCG	3	9	2690	2698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112138
81	NC_007963	GGC	2	6	2873	2878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112139
82	NC_007963	CCGGG	2	10	2893	2902	0 %	0 %	60 %	40 %	92112139
83	NC_007963	GCAT	2	8	2956	2963	25 %	25 %	25 %	25 %	92112139
84	NC_007963	ATG	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112139
85	NC_007963	GCG	2	6	3133	3138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112139
86	NC_007963	CTG	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112139
87	NC_007963	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112139
88	NC_007963	GGC	2	6	3283	3288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112139
89	NC_007963	GAGC	2	8	3386	3393	25 %	0 %	50 %	25 %	92112139
90	NC_007963	TGC	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112139
91	NC_007963	TCGCT	2	10	3483	3492	0 %	40 %	20 %	40 %	92112139
92	NC_007963	AGC	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112139
93	NC_007963	CTG	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112139
94	NC_007963	ACCG	2	8	3552	3559	25 %	0 %	25 %	50 %	92112139
95	NC_007963	TTGCGC	2	12	3600	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112139
96	NC_007963	TGC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112139
97	NC_007963	GGA	2	6	3632	3637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112139
98	NC_007963	TGG	2	6	3661	3666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112139
99	NC_007963	CCG	2	6	3748	3753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112139
100	NC_007963	CGG	2	6	3771	3776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112139
101	NC_007963	TTA	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	92112139
102	NC_007963	TGG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112140
103	NC_007963	CGA	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112140
104	NC_007963	GTG	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112140
105	NC_007963	ATCC	2	8	4126	4133	25 %	25 %	0 %	50 %	92112140
106	NC_007963	GCA	2	6	4207	4212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112140
107	NC_007963	TCA	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112140
108	NC_007963	TGC	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
109	NC_007963	CGG	2	6	4239	4244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
110	NC_007963	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112140
111	NC_007963	CGT	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
112	NC_007963	GAG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112140
113	NC_007963	GTG	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112140
114	NC_007963	CGA	2	6	4554	4559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112140
115	NC_007963	GAG	2	6	4573	4578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112140
116	NC_007963	GGC	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
117	NC_007963	TCG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
118	NC_007963	CAA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112140
119	NC_007963	GAC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112140
120	NC_007963	TCT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112140
121	NC_007963	CAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112140
122	NC_007963	GGC	2	6	4768	4773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
123	NC_007963	GAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112140
124	NC_007963	GAT	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112140
125	NC_007963	GC	3	6	4879	4884	0 %	0 %	50 %	50 %	92112140
126	NC_007963	TTC	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112140
127	NC_007963	TCC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112140
128	NC_007963	CGG	2	6	4976	4981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
129	NC_007963	TCG	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
130	NC_007963	CAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112140
131	NC_007963	GCG	2	6	5068	5073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
132	NC_007963	GGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
133	NC_007963	CGT	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
134	NC_007963	GC	3	6	5302	5307	0 %	0 %	50 %	50 %	92112140
135	NC_007963	CGG	2	6	5327	5332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
136	NC_007963	GAG	2	6	5377	5382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112140
137	NC_007963	ATC	3	9	5413	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112140
138	NC_007963	CCGACG	2	12	5426	5437	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	92112140
139	NC_007963	GCT	3	9	5460	5468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
140	NC_007963	TTC	3	9	5473	5481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112140
141	NC_007963	GCC	2	6	5529	5534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112140
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145	NC_007963	CG	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	92112140
146	NC_007963	TGC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112140
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149	NC_007963	CTT	2	6	5982	5987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112140
150	NC_007963	CG	3	6	6063	6068	0 %	0 %	50 %	50 %	92112140
151	NC_007963	TGA	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112140
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153	NC_007963	CGG	2	6	6220	6225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112140
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155	NC_007963	ATG	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112140
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159	NC_007963	GTC	2	6	6524	6529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112141
160	NC_007963	CTG	2	6	6613	6618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112141
161	NC_007963	CTG	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112141
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164	NC_007963	GATT	2	8	6870	6877	25 %	50 %	25 %	0 %	92112141
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170	NC_007963	GAA	2	6	7501	7506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112142
171	NC_007963	AGCG	2	8	7557	7564	25 %	0 %	50 %	25 %	92112142
172	NC_007963	AGC	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112142
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176	NC_007963	TTG	2	6	7706	7711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112142
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248	NC_007963	CGA	2	6	11677	11682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112145
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250	NC_007963	AGC	2	6	11853	11858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112145
251	NC_007963	CGCC	2	8	11875	11882	0 %	0 %	25 %	75 %	92112145
252	NC_007963	GAG	2	6	11945	11950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112145
253	NC_007963	CGA	2	6	12004	12009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112145
254	NC_007963	CAG	2	6	12011	12016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112145
255	NC_007963	ATG	2	6	12062	12067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112145
256	NC_007963	TGG	2	6	12135	12140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112145
257	NC_007963	GGC	2	6	12167	12172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112145
258	NC_007963	GACGCC	2	12	12179	12190	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	92112145
259	NC_007963	CGCA	2	8	12239	12246	25 %	0 %	25 %	50 %	92112145
260	NC_007963	GTC	2	6	12257	12262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112145
261	NC_007963	CAG	2	6	12281	12286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112145
262	NC_007963	GGC	3	9	12319	12327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112145
263	NC_007963	CGC	3	9	12378	12386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112145
264	NC_007963	CTG	2	6	12497	12502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112145
265	NC_007963	CGC	2	6	12514	12519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112145
266	NC_007963	CGCT	2	8	12536	12543	0 %	25 %	25 %	50 %	92112145
267	NC_007963	TTC	2	6	12621	12626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112146
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269	NC_007963	CGG	2	6	12668	12673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112146
270	NC_007963	CG	3	6	12674	12679	0 %	0 %	50 %	50 %	92112146
271	NC_007963	CGG	2	6	12758	12763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112146
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291	NC_007963	GCC	2	6	13465	13470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112146
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342	NC_007963	CAGC	2	8	15741	15748	25 %	0 %	25 %	50 %	92112148
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345	NC_007963	TCG	2	6	15865	15870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112148
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394	NC_007963	TTC	2	6	18264	18269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112150
395	NC_007963	TCG	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112150
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500	NC_007963	TGC	2	6	22181	22186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112153

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